赵晓璐副研究员近年来主要以四膜虫为模式材料，利用其独特的双元核型和接合生殖等特征，聚焦“表观遗传调控机制”这一科学问题，开展了系列研究，首次鉴定出催化组蛋白 H3K27 甲基化的 EZL1 多梳蛋白复合体组分，揭示了多梳蛋白复合体抑制通路与 RNA 干扰通路共同调控组蛋白甲基化的关键耦联蛋白，并阐述了该多梳蛋白复合体在染色质上精确定位的分子机制；证实了 RNA 干扰介导的多梳蛋白抑制通路可调控转座元件的沉默与激活，从而维持基因组稳定与进化间的平衡，针对转座元件的沉默与激活这一普遍生物学事件，形成了一份互证的数据链；同时对其下游产物染色体外环状 DNA，构建了预测染色体外环状 DNA（eccDNA）在表观遗传层面调控基因表达功能的数据库平台CircleBase，通过结合测序数据集、计算预测和手工注释等，对目前公开发表的 60 多万个 eccDNA 表观遗传调控潜能完成了系统的梳理和预测； 探讨和描绘了组蛋白 H3 K27 单甲基化酶 TXR1 识别双底物的分子机制，为探究表观遗传信息调控 DNA 复制延伸的分子机制奠定了重要基础。