于飞副教授主要从事动植物互作与群落更新机制研究，基于10余年温带森林生态系统鼠类与植物群落互作规律开展长期定位研究，阐明了基于动物介导的种子扩散对松栎混交林形成的影响及共优种共存机制，揭示了基于生境异质性的动植物互作网络对群落更新的作用机制等。
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