樊惠中博士专注于濒危动物保护遗传学及保护基因组学研究，目前以第一作者和共同第一作者身份发表SCI论文8篇。其中，代表性论文发表于Science Advances (影响因子：13.116)、Genome Biology (影响因子：10.806) 等专业性期刊。

       近20年来，保护遗传学和保护基因组学在中国取得了快速发展和长足进步。樊惠中博士所在团队系统总结了我国濒危脊椎动物不同类群物种（食肉目、灵长目、鲸偶题目、两栖类、鸟类、爬行类）在保护遗传学和保护基因组方面的进展。研究从非损伤性遗传取样、景观遗传学、遗传多样性、种群遗传学、种群历史以及适应性进化等几个方面全面地阐述了近20年中国学者在保护遗传学和保护基因组学方面取得的各项成果。另外，进一步探讨了保护遗传学和保护基因组学未来的发展方向。该论文已发表在《Journal of Genetics and Genomics》杂志上，申请人为第一作者。