于黎研究员长期扎根云南边疆，围绕物种多样性成因的科学问题，利用中国西南地区的动物资源优势，选取食肉目和灵长目中经历适应辐射的典型类群为研究对象，开展分子系统发育和适应性进化机制研究工作，取得一系列突出的原创性成果。研究成果推动了生物多样性演变机制及生物多样性保护的分子基础研究。迄今为止，发表论文70篇，包括在国际顶尖刊物Nature Genetics (影响因子30.331)、National Science Review (影响因子15.209)、Molecular Biology and Evolution (影响因子13.401)、Systematic Biology (影响因子9.765)等发表。研究成果被Nature Genetics评述和Faculty of 1000推荐，被国际专著Evolutionary Biology收录和综述期刊Trends in Genetics, Annual Review of Animal Biosciences引用。